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1.改進土壤營養(yǎng)供給狀況

菌肥主要通過各種菌劑促進土壤中難溶性營養(yǎng)的溶解、開釋。菌劑在代謝過程中開釋出很多的無機有機酸性物質，促進土壤中微量元素硅、鋁、鐵、鎂、鉬等的開釋及螯合，有用打破土壤板結，促進團粒結構的構成，使被土壤固定的無效肥料轉化成有用肥料，改進了土壤中營養(yǎng)的供給狀況、通氣狀況及疏松程度。

1.促進作物生長

菌肥的運用，促進了刺激素的發(fā)生，調理、促進作物的生長發(fā)育。菌劑的運用，能夠促進赤霉素、生長素和其他活性物質的發(fā)生。

1.增強作物抗病抗逆才能

菌肥中部分菌種具有排泄抗菌素和多種活性酶的功用，抑制或殺死致病真菌和細菌；很多的田間試驗證明，菌肥的應用能夠降低病蟲害發(fā)生率及增強作物的抗逆性能。